实验原理
ChIP与第二代测序技术相结合的ChIP-Seq技术,能够高效地在全基因组范围内检测与组蛋白、转录因子等互作的DNA区段,研究体内转录因子和靶基因启动子区域直接相互作用的方法,对调控蛋白在基因组上的结合靶点筛选、差异化表观遗传变异的原理揭示提供了重要的解决思路。
实验步骤
适用研究
筛选调控蛋白在基因组上的结合靶点,揭示差异化表观遗传变异的原理,研究表观遗传变异疾病
样本要求
目的基因或转录因子的相关背景资料;动物:细胞系、低脂肪含量组织液氮速冻样本(细胞数大于5×106个);
样品运输:干冰运输,建议用灭菌的样品袋或LoBind 管,parafilm将管口密封好。
结果提供
ChIP-DNA:分布在100~500bp范围,且主要片段在~250bp;总量≥5ng;Input率;
阴性对照抗体对目的片段的富集程度小于检测抗体2倍以上。